Крым давно попал в сферу интересов России. Интересы укрепления России на юге и безопасности её границ диктовали необходимость присоединения Крымского полуострова. В 1687-1689 гг. возглавляемая князем В. Голицыным русская армия дважды подступала к Перекопу, но оба раза вынуждена была вернуться ни с чем. Поудачливее оказался в 1736 г. фельдмаршал Б. Миних, прорвавший укрепления Перекопа и подступивший к Гезлёву. Татары, впрочем, боя не приняли и бежали в Бахчисарай, предварительно, правда, не забыв поджечь городские постройки. Отряд под руководством полковника М. Бирона застал на пепелище лишь около 40 армянских торговцев. Вскоре из-за начавшихся болезней русская армия покинула полуостров. Заключённый в 1739 г. Белградский мирный договор не принёс России ожидаемых результатов. Крым по-прежнему оставался под протекторатом Турции.
  Лишь в ходе войны 1768 - 1874 гг. поставленные задачи были решены. В 1771 г. русские войска, возглавляемые князем В.М. Долгоруковым, вновь взяли Гезлёв. Кючук-Кайнарджийским мирным договором Крым становился независимым от Османской империи. В 1783 г. полуостров был присоединён к Российской империи. В 1784 г. указом императрицы Екатерины II Гезлёв был переименован в Евпаторию (в память о Митридате Евпаторе) и возведён в ранг уездного города.
  В связи с эмиграцией крымских татар в 80-90 гг. XVIII в., население города и уезда резко сократилось, однако русское правительство наладило поток переселенцев в этот благодатный край, и экономическое положение региона быстро наладилось. Был заново отстроен порт, и Евпатория довольно скоро превратилась в один из самых больших портов Крыма. Уже в 1801 г. на городском рейде стояло до 170 судов. Два раза в год - в начале мая и начале сентября устраивались ярмарки, на которых заключались торговые сделки с торговцами со всего Средиземноморья.
Город по архитектурному облику всё ещё оставался восточным, в нём было около 2 тысяч домов, а его население выросло незначительно - до 11 тыс. человек. С начала XIX в. Евпатория становится центром караимизма - сюда ещё в конце XVIII в. переезжает духовный глава караимов - гахам . Здесь же в 1807-1815 гг. строится два храма - кенассы для праздничных и будних богослужений, сохранившихся и по сей день.
  Провинциальную тишину уездного города нарушила Крымская война. Вторжение англо-французских союзников в Крым началось с высадки 1(13) сентября 1854 г. 62-тычячного десанта в окрестностях Евпатории. Город, не имея возможности обороняться, сразу капитулировал. Союзники превратили Евпаторию в свой опорный пункт и базу снабжения. 5(17) февраля русские войска под командованием генерала С.А.Хрулёва, в стремлении облегчить участь осаждённого Севастополя осадили её, но взять так и не смогли и вынуждены были отойти. Крымская война подорвала хозяйство города и уезда, и потребовала времени на его восстановление.
Динамизм развитию города придали реформы 60 70 гг. ХIХ в. Вырос торговый оборот Евпаторийского порта, который в 1913 г. посетило аж 2291 судно. В несколько раз выросла добыча соли, развивались городские ремёсла. Благоустраивался город, население которого к 1912 г. составило 30 тыс. чел. Были сделаны первые шаги к развитию курортной инфраструктуры: в 1884 г. врачами Ходжашем и Цеценовским было взято в аренду озеро Мойнаки и открыта лечебница. В 1905 г. был открыт первый частный санаторий "Приморский". В последующие девять лет были построены водолечебница, санатории "Таласса", "Гелиос", "Чайка" - всего 635 коек. В 1913 г. на средства городской управы была пущена линия трамвая от центра города к водолечебнице. В 1915 г. Евпатория была соединёна железнодорожной веткой с магистралью Севастополь-Москва. Однако начавшаяся смута - революция и гражданская война - на время приостановила развитие города.
  Сегодня Евпатория крупный центр туристического бизнеса с развитой инфраструктурой. Не глубокое и теплое море, мягкий климат привлекают сюда в летнее время большое количество отдыхающих и туристов.